Methylierungsprofil zirkulierender zell-freier DNA als diagnostisches Hilfsmittel für eine verbesserte Klassifizierung von Herzkreislauferkrankungen

Im Durchschnitt ist diese DNA ~170bp lang, was einer Windung um ein Nukleosom inklusive zweier Verbindungsregionen an jedem Ende umfasst. Die Methylierung von bestimmten Regionen der DNA ist sehr zellspezifisch und erlaubt dadurch eine klare Zuordnung der Herkunft. In unseren Vordaten konnten wir zeigen, dass sich Patienten mit einem akutem Koronarsyndrom (ACS) unterschiedlichen Ausmaßes durch das Methylierungsprofil ihrer freigesetzten DNA unterscheiden. Um noch ein klareres Bild zu bekommen, untersuchen wir in diesem Projekt nun Herzinsuffizienzpatienten mit reduzierter oder konservierter Auswurffraktion. Hier werden wir wie bei den vorangegangenen Patientenproben eine Gesamtgenomsequenzierung von bisulfitkonvertierter DNA durchführen und zahlreiche unterschiedlich methylierte Regionen identifizieren, die entweder denen der schon untersuchten ACS Gruppierungen entsprechen oder ein neues Herzinsuffizienz-spezifisches Profil zeigen. Wir arbeiten momentan an einer Verbesserung unserer Softwarealgorithmen, welche eine Priorisierung der besten Marker aus einer Vielzahl an identifizierten Kandidaten erlaubt, sowie der Miniaturisierung des Prüfverfahren und einer damit verbundenen selektiven Targetsequenzierung. Unsere Technologie wird für viele Herzkreislauferkrankungen wie z.B. Herzinsuffizienz aber auch deren Komorbiditäten anwendbar sein, um sowohl Erkrankungsfortschritt oder deren Regress zu verfolgen als auch die Effizienz der medizinischen Behandlung zu beobachten. Unser ultimatives Ziel ist es, mit unserem nichtinvasiven, kosteneffizienten diagnostischen Ansatz zum Wohlbefinden und der Krankheitsvorsorge in unsere Gesellschaft beizutragen.

Publikationen

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